在医改意见中，把农民工看作了职工，他们的医保有了两个选择：一是在原先的居住地，一是务工所在地。对农民工来说，一般都是从相对落后地进入经济相对发达的地区去打工，他们在务工地参加医疗保险，能够获得比较高的医疗保障水平。专家认为，如果真正能解决好流动人口的医保问题，异地医保的问题也就随之解决。

意见中提出：“随着经济发展，逐步提高筹资水平和统筹层次，缩小保障水平差距，最终实现制度框架的基本统一”。北京大学政府管理学院教授顾昕认为，意见中提出了建立覆盖城乡居民的基本医疗保障体系，将农民和居民、城镇和乡村合一，为医保体系建设指出了方向。